萬級無塵車間的設計規劃，動線規劃要點：要檢討分析人車路徑、配管系統、排氣管道、原料搬運和作業的流程等，盡量縮短動線，并避免交叉，以防止交叉污染。作業者、化學藥品、材料等動線勿集中；無塵車間四周，宜設緩沖區；制造裝置的出入，不要對作業產生大影響。
1、無塵車間不同級別空氣潔凈度的空氣過濾器的選用、布置要點：對于300000級空氣凈化處理，可采用亞高效過濾器代替高效過濾器；空氣潔凈度100級、10000級及100000級的空氣凈化處理，應采用初、中、高效過濾器三級過濾器；中效或高效空氣過濾器宜按小于或等于額定風量選用；中效空氣過濾器 宜集中設置在凈化空氣調節的正壓段；高效或亞高效空氣過濾器宜設置在凈化空氣調節系統的末端。
2、有些空氣凈化系統的空氣，如經處理仍不能避免交叉污染時，則不能循環使用：固體物料的粉碎、稱重、配料、混合、制料、壓片、包衣、灌裝等工序；用有機溶媒精制的原料藥精制、干燥工序；放射性藥品生產區；病原體操作區；工藝過程中產生大量有害物質、揮發性氣體的生產工序；固體口服制劑的顆料。